Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3cP0DOY1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms