Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefmP08553 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NefmP08553 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefmP08553 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefmP08553 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefmP08553 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefmP08553 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefmP08553 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefmP08553 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NefmP08553 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefmP08553 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefmP08553 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefmP08553 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefmP08553 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefmP08553 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefmP08553 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefmP08553 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefmP08553 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefmP08553 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefmP08553 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefmP08553 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefmP08553 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefmP08553 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefmP08553 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefmP08553 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefmP08553 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefmP08553 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefmP08553 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefmP08553 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefmP08553 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefmP08553 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefmP08553 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefmP08553 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefmP08553 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefmP08553 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefmP08553 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefmP08553 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefmP08553 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NefmP08553 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefmP08553 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NefmP08553 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefmP08553 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefmP08553 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefmP08553 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefmP08553 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefmP08553 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefmP08553 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefmP08553 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefmP08553 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefmP08553 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefmP08553 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefmP08553 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefmP08553 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefmP08553 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefmP08553 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefmP08553 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefmP08553 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefmP08553 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefmP08553 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefmP08553 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefmP08553 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefmP08553 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefmP08553 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefmP08553 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefmP08553 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefmP08553 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefmP08553 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefmP08553 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefmP08553 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefmP08553 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefmP08553 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefmP08553 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms