Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdgfrbP05622 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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