Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01679 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01679 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01679 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01679 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01679 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01679 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01679 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01679 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01679 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01679 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01679 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01679 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01679 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01679 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01679 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01679 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01679 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01679 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01679 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01679 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01679 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01679 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01679 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01679 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01679 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01679 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01679 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01679 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01679 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01679 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01679 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01679 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01679 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01679 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01679 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P01679 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01679 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01679 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01679 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P01679 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01679 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms