Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01672 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01672 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01672 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01672 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01672 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01672 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01672 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01672 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01672 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01672 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01672 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01672 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01672 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01672 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01672 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01672 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01672 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01672 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
P01672 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01672 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
P01672 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01672 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01672 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01672 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01672 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01672 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01672 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01672 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01672 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01672 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01672 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01672 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01672 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01672 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01672 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01672 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01672 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01672 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01672 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01672 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01672 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01672 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01672 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01672 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01672 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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