Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01655 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01655 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01655 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01655 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01655 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01655 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01655 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01655 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01655 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01655 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01655 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01655 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01655 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01655 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms