Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01648 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01648 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01648 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01648 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01648 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01648 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01648 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01648 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01648 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01648 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01648 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01648 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01648 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01648 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01648 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01648 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01648 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01648 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01648 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01648 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01648 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01648 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01648 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01648 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01648 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01648 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01648 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01648 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01648 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01648 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01648 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01648 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01648 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01648 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01648 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01648 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01648 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01648 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01648 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01648 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01648 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01648 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01648 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01648 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01648 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01648 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01648 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms