Protein–RNA interactions for Protein: O88253

Gm10226, Mszf39 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10226O88253 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10226O88253 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10226O88253 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10226O88253 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10226O88253 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10226O88253 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10226O88253 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10226O88253 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10226O88253 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10226O88253 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10226O88253 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10226O88253 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10226O88253 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10226O88253 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10226O88253 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10226O88253 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10226O88253 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10226O88253 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10226O88253 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm10226O88253 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm10226O88253 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm10226O88253 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm10226O88253 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm10226O88253 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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