Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnk2O54967 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms