Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FxnO35943 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FxnO35943 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FxnO35943 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FxnO35943 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FxnO35943 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FxnO35943 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FxnO35943 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FxnO35943 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FxnO35943 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FxnO35943 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FxnO35943 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
FxnO35943 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FxnO35943 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FxnO35943 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FxnO35943 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FxnO35943 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FxnO35943 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FxnO35943 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FxnO35943 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FxnO35943 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FxnO35943 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FxnO35943 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FxnO35943 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FxnO35943 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FxnO35943 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FxnO35943 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FxnO35943 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FxnO35943 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FxnO35943 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FxnO35943 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FxnO35943 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FxnO35943 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FxnO35943 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FxnO35943 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FxnO35943 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FxnO35943 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FxnO35943 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FxnO35943 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FxnO35943 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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FxnO35943 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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FxnO35943 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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FxnO35943 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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FxnO35943 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FxnO35943 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FxnO35943 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FxnO35943 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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FxnO35943 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FxnO35943 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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FxnO35943 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FxnO35943 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FxnO35943 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FxnO35943 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FxnO35943 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FxnO35943 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FxnO35943 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FxnO35943 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FxnO35943 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FxnO35943 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FxnO35943 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FxnO35943 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FxnO35943 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FxnO35943 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FxnO35943 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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