Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gp1baO35930 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1baO35930 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1baO35930 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1baO35930 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1baO35930 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gp1baO35930 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1baO35930 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1baO35930 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1baO35930 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1baO35930 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gp1baO35930 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1baO35930 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1baO35930 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1baO35930 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1baO35930 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1baO35930 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1baO35930 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1baO35930 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1baO35930 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1baO35930 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms