Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CaluO35887 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CaluO35887 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CaluO35887 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CaluO35887 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CaluO35887 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CaluO35887 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CaluO35887 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CaluO35887 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CaluO35887 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CaluO35887 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CaluO35887 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CaluO35887 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CaluO35887 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CaluO35887 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CaluO35887 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CaluO35887 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CaluO35887 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CaluO35887 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CaluO35887 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CaluO35887 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CaluO35887 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CaluO35887 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CaluO35887 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CaluO35887 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CaluO35887 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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CaluO35887 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CaluO35887 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CaluO35887 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CaluO35887 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CaluO35887 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CaluO35887 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CaluO35887 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CaluO35887 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CaluO35887 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CaluO35887 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CaluO35887 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CaluO35887 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CaluO35887 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CaluO35887 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CaluO35887 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CaluO35887 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CaluO35887 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CaluO35887 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CaluO35887 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CaluO35887 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CaluO35887 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CaluO35887 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CaluO35887 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CaluO35887 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CaluO35887 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CaluO35887 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CaluO35887 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CaluO35887 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CaluO35887 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CaluO35887 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CaluO35887 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CaluO35887 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CaluO35887 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms