Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clk4O35493 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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