Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TnxbO35452 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TnxbO35452 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms