Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms