Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f3O35261 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f3O35261 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2f3O35261 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms