Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP8

Alkal1, ALK and LTK ligand 1, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkal1J3QPP8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Alkal1J3QPP8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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