Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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