Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf4bG5E8Z2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms