Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms