Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfip1G5E8V9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms