Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcf11G3X9Z4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcf11G3X9Z4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms