Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp72F8VQC1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Srp72F8VQC1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Srp72F8VQC1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Srp72F8VQC1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Srp72F8VQC1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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