Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Crocc2F6XLV1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Crocc2F6XLV1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Crocc2F6XLV1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Crocc2F6XLV1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Crocc2F6XLV1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Crocc2F6XLV1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Crocc2F6XLV1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Crocc2F6XLV1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Crocc2F6XLV1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Crocc2F6XLV1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Crocc2F6XLV1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Crocc2F6XLV1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Crocc2F6XLV1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Crocc2F6XLV1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms