Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms