Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc175E9PVB3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms