Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim12cD3Z3L3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms