Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ldlrad1D3YYZ1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldlrad1D3YYZ1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms