Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Pdzd8B9EJ80 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzd8B9EJ80 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pdzd8B9EJ80 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pdzd8B9EJ80 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pdzd8B9EJ80 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pdzd8B9EJ80 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pdzd8B9EJ80 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pdzd8B9EJ80 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pdzd8B9EJ80 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdzd8B9EJ80 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdzd8B9EJ80 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdzd8B9EJ80 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdzd8B9EJ80 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdzd8B9EJ80 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdzd8B9EJ80 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdzd8B9EJ80 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdzd8B9EJ80 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdzd8B9EJ80 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdzd8B9EJ80 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdzd8B9EJ80 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdzd8B9EJ80 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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