Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms