Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cspp1B2RX88 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cspp1B2RX88 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms