Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Rd3lB2RV38 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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Rd3lB2RV38 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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