Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Abcc8B2RUS7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Abcc8B2RUS7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms