Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Usf3B2RUQ2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Usf3B2RUQ2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Usf3B2RUQ2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Usf3B2RUQ2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Usf3B2RUQ2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Usf3B2RUQ2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usf3B2RUQ2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms