Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ythdc2B2RR83 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ythdc2B2RR83 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ythdc2B2RR83 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ythdc2B2RR83 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ythdc2B2RR83 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ythdc2B2RR83 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ythdc2B2RR83 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ythdc2B2RR83 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ythdc2B2RR83 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdc2B2RR83 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdc2B2RR83 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdc2B2RR83 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdc2B2RR83 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdc2B2RR83 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdc2B2RR83 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdc2B2RR83 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdc2B2RR83 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdc2B2RR83 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdc2B2RR83 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdc2B2RR83 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdc2B2RR83 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdc2B2RR83 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdc2B2RR83 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdc2B2RR83 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdc2B2RR83 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms