Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms