Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl41A2AUC9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms