Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SktA2AQ25 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms