Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CtcflA2APF3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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