Protein–RNA interactions for Protein: A2ALK8

Ptpn3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn3A2ALK8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ptpn3A2ALK8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn3A2ALK8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms