Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rbbp8nlA2ABX0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8nlA2ABX0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms