Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm16A2A935 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms