Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfkbiaQ9Z1E3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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