Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ror1Q9Z139 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ror1Q9Z139 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms