Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slfn1Q9Z0I7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms