Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubd1Q9R1K7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms