Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod3Q9R0E1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms