Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf4Q9QZS2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms