Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc3Q9QZC1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms