Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a3Q9QZB6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms